美原自然保護中心設立於1993年(平成5年)，
主要的目的是希望能夠讓來美原的遊客們了解美原的原生植物及野生動物等物種的生存環境，
並讓遊客知道自然保護的重要性及遊玩時的注意事項等。
此外，也是自然保護人員等將一整年的自然觀察記錄、外來物種驅除等經過報告的資料彙整據點。